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细菌人造染色体BAC文库

从1997年起,我们已经为客户构建了高质量的cDNA和DNA文库。 我们的客户包括美国农业部、加拿大农业部、杜邦公司下属的Pioneer Hi-Bred Int'l、拜耳公司、嘉吉公司、美国哈佛大学、 英国剑桥大学以及在德国的Max Planck 研究所等机构。我们承诺快周期、合理的价格和大的插入片段。

若需要,我们会很高兴地向您提供使用过我们公司服务的人或机构作为参考人。

一个阵列BAC文库(由客户提供阵列)是为希望使用杂交技术来筛选的研究人员的首选。

一个阵列文库也可以用来做整个基因组测序或者物理图谱构建的唯一模板。请联系areti@biost.com.

你打算只是要筛选几个目标克隆吗?请访问我们的 BAC文库筛选部分.


亮点


我们通常会建立一个至少5倍BAC文库容量的文库,其中保证了99.3%的发现目标序列的概率。还可以提供额外的覆盖以及双酶切服务(另外计费)。我们也可以按客户的需求来调整我们的服务。
覆盖率是有保证的。收到的克隆都是基于我们承诺的覆盖率和120kb的平均插入片段。如果插入的片段小于120kb,我们会增加克隆的数量。
HMW DNA isolation and QC by HMW DNA enzymatic digestion are included.


交付

阵列BAC文库(包括挑克隆)

  1. 阵列克隆并且在384孔板里扩增(1个单一克隆/孔),并且用干冰运输。
  2. 保证基因组的覆盖率。
  3. 微孔板用条形码标签区分。


未阵列的BAC文库(不包括挑克隆)

  1. 保证基因组的覆盖率。
  2. 贮存在甘油里,用干冰运输的未扩增的BAC克隆混合物(转化后的含有BAC DNA的E. coli 细胞)。
  3. 免费多送5%的克隆以补偿运输过程中的滴度损失。
  4. 这个选项推荐给那些研究大基因组和/或有能力做阵列和/或想要控制运输费用的科学家。

相关服务

  1. 杂交尼龙网:可以提供小容量(8×12cm;最多3,702个克隆)和大容量(22.5 ×22.5cm;最多18,432个克隆)。最少定单数为3套。尼龙膜可以用来做克隆的杂交,一式2份。
  2. BAC文库拷贝:只有阵列BAC文库可选。可以选择为主BAC文库拷贝并且贮存或者运输。
  3. 新来自阵列BAC文库的超级池或者池化打包:我们提供细胞池和DNA池,可以让客户马上进行筛选:
    1. 盘池:1个池/盘
    2. 超级池:甘油保存+提取的DNA;不包括超级池的盘
    3. 行池
    4. 列池

要获得更多细节,请参看 超级池和池的打包。


我们的强项

  • 我们保证覆盖率。
  • 高的平均插入片段和插入片段大小分布(见以下图表1)。
  • 用我们自己的设备进行高分子量DNA 的抽提。
  • 我们有着构建植物、真菌、细菌和动物文库的经验。
  • 我们有着处理高GC含量的生物和海洋细菌的经验。
  • 我们的阵列BAC文库是用带条形码的微孔板来运输。
  • 我们有着运往世界各地的丰富的运输经验。
  • 运用蓝旗温度数据记录仪来监控非阵列文库的运输。
  • 我们提供技术支持。
  • BAC文库是客户的财产,我们绝对不会在内部使用,出售或者分发。
  • 我们会很高兴地向客户提供曾经使用过我们公司服务的人作为参考。

Table 1: A few libraries constructed in the past with obtained average insert sizes.

Starting material Insert size
Musmusculus 180 Kb
Zea mays 150 Kb
P. brassicacearum 160 Kb
P. omnivore 185 Kb
Arabidopsis thaliana 150 Kb
Homo sapiens 215 Kb


Figure 1: PFG following NotI digestion of insect BAC clones ( Mamestra configurata ) with an average insert size of 178Kb

Insect

Figure 2: PFG following NotI digestion of fungal BAC clones P. omnivora) with an average insert size of 185Kb.

fungal

Graph 1: BAC clone insert size distribution (average of 140Kb) of a Soybean BAC library (Glycine max).

BAC文库的应用

BAC文库是进行大规模基因组研究时最基本的元素单位, 这样的研究包括:目标基因的筛选,生物合成路径基因簇的克隆,转基因鉴定,基因/基因簇功能的分析,物理图谱(基因定位)和基因组的测序,等等。细菌人造染色体(BAC)克隆技术是在20世纪90年代初被研究开发出来的,并迅速获得科学家们的采用和普及,当时的BAC文库主要应用于深入了解基因网络叠构的影响,尤其是基因累加和基因组方向变化性的效应等问题。尽管该技术比酵母人工染色体(YAC)和基于cosmid/fosmid基因组文库克隆技术发展得更晚,但由于BAC文库比YAC和cosmid/fosmid文库更具有的以下技术优势,它很快就变得很流行和发展起来:

  1. 比cosmid/fosmid和其他质粒系统有更大的插入片段(最高可达300 kb),
  2. 比酵母系统的更稳定,
  3. BAC文库的DNA更容易提取(超螺旋BAC DNA与线性YAC DNA之比)。

BAC文库的另一主要应用还在于大规模物理图谱和基因组测序。 以下是一些应用示例:

文库筛选

为分离和获取目标大片段基因克隆,BAC文库可以加速其筛选进程,提高筛选速度。

有关生物合成途径基因簇的分离

BAC文库可用于筛选源于土壤和海洋环境的微生物的生物合成途径的基因簇。这可以有效地帮助人们在药物研发(主要是抗生素),植物遗传和微生物代谢研究中尽快发现所寻找的新的化合物和用于工业微生物生产的新的生物酶。

FISH探针的制备

FISH (Fluorescence In Situ Hybridization探针通常都是由BAC克隆制成的。该技术可用于检测染色体重排,异倍体和DNA的缺失等遗传问题。

双元载体的BAC克隆用于植物图位克隆的互补转化试验

用DNA碱基互补配对的原理,BAC文库可用于检测植物基因组的遗传结构及其基因型突变的分析。这为科学家们提供了一个可靠的工具来研究植物物种中的通用性基因的表达及单个基因的分离。

物理图谱和基因组测序

BAC文库和其重叠BAC克隆是基因组测序和重叠区组装的重要工具。