Les trousses APAgene™ GOLD-RT pour l’arpentage génomique peuvent maintenant être livrées à température ambiante !
Les clients internationaux peuvent économiser sur les frais de transport !
Notre trousse a été couronné la MEILLEURE parmi nos compétiteurs : Molecular Biotechnology (D. Cullen et al., 11 January 2011 pp. 1-13)
Applications
Les trousses APAgene™ GOLD pour l’arpentage génomique sont conçues pour amplifier de l’ADN génomique inconnu de façon rapide (1 jour !) et fiable, en utilisant notre technologie brevetée APA. Également disponible, et en promotion, notre service d'ARPENTAGE APA.
APAgene™ GOLD est l’outil génomique idéal car il permet de mener à bien toute une gamme d’expériences en génétique moléculaire:
- Isoler des séquences inconnues encadrant des transgènes (incluant ADN-T, pièges à gènes et transposons), des marqueurs STS (sequence tagged site, site étiqueté par une séquence) ou étiquettes de séquences transcrites (ESTs, expressed sequence tags).
- Isoler des séquences locales encadrant des séquences connues de gros clones et d’ADN génomique.
- Séquencer les extrémités d’inserts de gros clones tels que des ADN de BAC, YAC ou P1.
- Isoler les régions inconnues contrôlant les promoteurs (en 5’) et les terminateurs de transcription (en 3’) des ADNc.
- Isoler les séquences inconnues par RACE 5’ et 3’ à partir d’ADNc simple brin.
Procédure d’amplification
Notre technologie brevetée repose sur une combinaison d’amorces de marquage aléatoires (random tagging primers, DRT), fournies par Bio S&T, et d’amorces spécifiques au gène d’intérêt (gene-specific primers, GSP), fournies par le client. Normalement, trois amorces spécifiques imbriquées (GSPa, GSPb et GSPc) sont requises dans la réaction pour l’amplification de régions flanquantes.
Les amorces DRT sont des amorces universelles consistant en trois parties :
- Une séquence dégénérée
- Une séquence aléatoire
- Une séquence de marquage
Toutes les amorces DRT ont en commun la séquence de marquage, mais ont des séquences aléatoires différentes. Le succès de la réaction d’arpentage dépend de la fixation des amorces DRT aux séquences flanquantes pendant la réaction de PCR primaire. Nos amorces DRT brevetées, ainsi que nos tampons et conditions de PCR optimisés, améliorent grandement la procédure d’amplification.
Trousses offertes
Nous offrons deux trousses d’arpentage génomique APAgene™ GOLD. Les deux trousses donnent d’excellents résultats. BT901 est la plus récente de nos trousses et nous la recommandons à tous. BT501 est une version plus vieille que beaucoup de nos clients fidèles préfèrent.
BT901-RT (format de 10 réactions)
Cette trousse utilise des amorces UAP contenant une structure en épingle à cheveux, ce qui rend l’amplification non spécifique beaucoup moins efficace que l’amplification des séquences ciblées. Trousses d’arpentage génomique APAgene™ GOLD-RT(livrées à température ambiante
|
|
|
|
|
|
Quelques références
- A naturally occurring epigenetic mutation in a gene encoding an SBP-box transcription factor inhibits tomato fruit ripening, Kenneth Manning et al., Nature Genetics, Volume: 38, Issue: 8, Date: 2006 07 28, Pages: 948-522
- A Na+: H+ Antiporter and a Molybdate Transporter Are Essential for Arsenite Oxidation in Agrobacterium tumefaciens, Journal of Bacteriology, February 2006, p. 1577-1584, Vol. 188, No. 4, Des R. Kashyap et al.
- Y chromosome microsatellite isolation from BAC clones in the greater white-toothed shrew (Crocidura russula), Lawson Handley, L.J., Perrin, N., 2006, Molecular Ecology Notes 60, 276-279.
- Complex Regulation of Arsenite Oxidation in Agrobacterium tumefaciens, Journal of Bacteriology, February 2006, p. 1081-1088, Vol. 188, No. 3, Des R. Kashyap et al.
- Identification and regulatory analysis of rainbow trout tapasin and tapasin-related genes, Immunogenetics 2006 Feb; 58(1) :56-69. Landis ED, Palti Y, Dekoning J, et al.
- Detection and Characterization of Amplified Fragment Length Polymorphism Markers for Clinical Mastitis in Canadian Holsteins, J Dairy Sci. 2006 Sep;89 (9):3653-63., B. S. Sharma et al.
- Homologs of CD83 from Elasmobranch and Teleost Fish, Yuko Ohta et al., The Journal of Immunology, 2004, 173: 4553-4560.