Séquençage génomique et séquençage de clones entiers BAC
1499 $ US (ou moins) par unité de 10 kb
Une unité est égale à 10 kb (insert + vecteur). Le coût final sera plus ou moins élevé dépendamment de la taille finale du génome assemblé. Le prix n’inclut pas l’annotation du génome.
Grandes lignes de la procédure:
- Culture cellulaire des clones de Chromosomes Artificiels de Bactéries (BAC)
- Extraction et purification de l’ADN de BAC.
- Détermination de la taille du BAC (vecteur plus insertion).
- Construction de la banque en aveugle aléatoire.
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Séquençage :
- Extraction et purification de la matrice d’ADN
- Séquençage en aveugle avec amorce universelle
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Rapports d’annotation en temps réel :
- Assemblage
- Alignement des contigs
- Identification des clones de liaison
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Remplissage des lacunes :
- Détermination des séquences des clones de liaison ou produits de PCR amplifiés aléatoirement d’après les amorces spécifiques aux extrémités des contigs.
- Couverture moyenne du génome de > 99%.
Special:
Les clients qui ont fait construire et cribler une banque de BAC par Bio S&T ou qui le feront dans l’avenir bénéficieront d’un taux préférentiel.
Séquençage des extrémités BAC
120 $ US par clone (deux côtés) pour < 5 clones
Le séquençage des extrémités de BAC est une technique puissante qui permet l’assemblage rapide et précis de séquences gigantesques (mégabases) dérivées de régions de chromosomes lors de projets de séquençage génomique à grande échelle. L’utilisation de la technologie de séquençage des extrémités de BAC dans l’alignement de grands fragments de génome peut éviter efficacement les lacunes et le séquençage inutile d’un grand nombre de répétitions résultant du clonage en aveugle.
Bio S&T utilisera la technologie APAgene pour séquencer les extrémités des clones de BAC d’intérêt. Le client recevra environ 300 pb de séquence par extrémité. Les données seront livrées dans un format texte et les chromatogrammes seront disponibles.
Le délai d’exécution est d’environ 1 semaine pour moins de 5 clones. Un prix de gros est disponible.